對於蕨類有興趣的朋友，國立自然科學博物館的植物園是絕佳的學習及賞蕨的地方，植物園位於前述主題區的後面，隔一條馬路，旁邊及地下室是停車場，園區內除了有一熱帶雨林溫室，裡面有許多的蕨類植物外，還有一間特展室，展覽主題為「蕨類天堂在台灣」，裡面至少有150種的蕨類植物，只要花門票20元，就可以暢遊前述兩個展覽館。
除了熱帶雨林溫室及特展室，植物園戶外的開放空間，更是蕨類的天堂，正門外面左右側人行道各不到100公尺的範圍內，住滿了蕨類植物，走到園區裡，到處都是蕨類植物。這裡的蕨類植物數量多、種類多、維護好，特展室裡對每種蕨類都清礎標示其名稱，堪稱是國內屬一屬二的蕨類植物園區，值得愛蕨人士到此一遊。
2016年
國立自然科學博物館植物園外面
國立自然科學博物館植物園入口
國立自然科學博物館植物園熱帶雨林溫室
國立自然科學博物館植物園特展室
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